Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CiartQ3TQ03 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CiartQ3TQ03 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CiartQ3TQ03 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CiartQ3TQ03 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CiartQ3TQ03 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CiartQ3TQ03 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CiartQ3TQ03 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CiartQ3TQ03 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CiartQ3TQ03 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CiartQ3TQ03 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CiartQ3TQ03 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms