Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctdnep1Q3TP92 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctdnep1Q3TP92 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms