Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf3c3Q3TMP1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf3c3Q3TMP1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms