Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cwc27Q3TKY6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms