Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Smarca4Q3TKT4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Smarca4Q3TKT4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Smarca4Q3TKT4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Smarca4Q3TKT4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Smarca4Q3TKT4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Smarca4Q3TKT4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Smarca4Q3TKT4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Smarca4Q3TKT4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Smarca4Q3TKT4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Smarca4Q3TKT4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Smarca4Q3TKT4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Smarca4Q3TKT4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Smarca4Q3TKT4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Smarca4Q3TKT4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Smarca4Q3TKT4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Smarca4Q3TKT4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Smarca4Q3TKT4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Smarca4Q3TKT4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Smarca4Q3TKT4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms