Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdlim7Q3TJD7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdlim7Q3TJD7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms