Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VrtnQ3SYK4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VrtnQ3SYK4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VrtnQ3SYK4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms