Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col24a1Q30D77 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col24a1Q30D77 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col24a1Q30D77 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col24a1Q30D77 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col24a1Q30D77 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col24a1Q30D77 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col24a1Q30D77 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col24a1Q30D77 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col24a1Q30D77 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Col24a1Q30D77 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col24a1Q30D77 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col24a1Q30D77 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col24a1Q30D77 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col24a1Q30D77 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col24a1Q30D77 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col24a1Q30D77 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col24a1Q30D77 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col24a1Q30D77 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col24a1Q30D77 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col24a1Q30D77 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col24a1Q30D77 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col24a1Q30D77 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col24a1Q30D77 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col24a1Q30D77 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms