Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp1aQ2LKU9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp1aQ2LKU9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms