Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam178bQ24JP3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam178bQ24JP3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam178bQ24JP3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam178bQ24JP3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam178bQ24JP3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam178bQ24JP3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam178bQ24JP3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam178bQ24JP3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam178bQ24JP3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam178bQ24JP3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam178bQ24JP3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam178bQ24JP3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam178bQ24JP3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam178bQ24JP3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam178bQ24JP3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam178bQ24JP3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam178bQ24JP3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam178bQ24JP3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam178bQ24JP3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam178bQ24JP3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam178bQ24JP3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam178bQ24JP3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms