Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpusd2Q149F1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpusd2Q149F1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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