Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc162pQ0VG85 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms