Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim24Q0VG18 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim24Q0VG18 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms