Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpne7Q0VE82 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cpne7Q0VE82 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cpne7Q0VE82 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cpne7Q0VE82 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cpne7Q0VE82 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cpne7Q0VE82 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cpne7Q0VE82 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cpne7Q0VE82 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cpne7Q0VE82 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cpne7Q0VE82 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cpne7Q0VE82 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cpne7Q0VE82 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms