Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rab42Q0PD08 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms