Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TrioQ0KL02 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TrioQ0KL02 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms