Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Kndc1Q0KK55 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Kndc1Q0KK55 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms