Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pate4Q09098 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pate4Q09098 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms