Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tff1Q08423 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tff1Q08423 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms