Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gata4Q08369 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gata4Q08369 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gata4Q08369 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gata4Q08369 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gata4Q08369 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gata4Q08369 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gata4Q08369 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gata4Q08369 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gata4Q08369 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gata4Q08369 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gata4Q08369 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gata4Q08369 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gata4Q08369 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gata4Q08369 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gata4Q08369 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gata4Q08369 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gata4Q08369 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gata4Q08369 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gata4Q08369 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gata4Q08369 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gata4Q08369 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gata4Q08369 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gata4Q08369 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gata4Q08369 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gata4Q08369 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gata4Q08369 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gata4Q08369 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gata4Q08369 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gata4Q08369 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gata4Q08369 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gata4Q08369 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gata4Q08369 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gata4Q08369 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gata4Q08369 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gata4Q08369 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gata4Q08369 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gata4Q08369 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gata4Q08369 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gata4Q08369 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gata4Q08369 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gata4Q08369 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms