Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdx4Q07424 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdx4Q07424 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdx4Q07424 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdx4Q07424 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdx4Q07424 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cdx4Q07424 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cdx4Q07424 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms