Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nfe2Q07279 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms