Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gdf3Q07104 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms