Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CluQ06890 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CluQ06890 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CluQ06890 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CluQ06890 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CluQ06890 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CluQ06890 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CluQ06890 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CluQ06890 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CluQ06890 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CluQ06890 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CluQ06890 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CluQ06890 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CluQ06890 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CluQ06890 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CluQ06890 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CluQ06890 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CluQ06890 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CluQ06890 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CluQ06890 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CluQ06890 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CluQ06890 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CluQ06890 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CluQ06890 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CluQ06890 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CluQ06890 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CluQ06890 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CluQ06890 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CluQ06890 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CluQ06890 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CluQ06890 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CluQ06890 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CluQ06890 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CluQ06890 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CluQ06890 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CluQ06890 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CluQ06890 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CluQ06890 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CluQ06890 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CluQ06890 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CluQ06890 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CluQ06890 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CluQ06890 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CluQ06890 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CluQ06890 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CluQ06890 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CluQ06890 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CluQ06890 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CluQ06890 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CluQ06890 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CluQ06890 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CluQ06890 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CluQ06890 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CluQ06890 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CluQ06890 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CluQ06890 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CluQ06890 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CluQ06890 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CluQ06890 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CluQ06890 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CluQ06890 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CluQ06890 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CluQ06890 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CluQ06890 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CluQ06890 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CluQ06890 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CluQ06890 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CluQ06890 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CluQ06890 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CluQ06890 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CluQ06890 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CluQ06890 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CluQ06890 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CluQ06890 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CluQ06890 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CluQ06890 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CluQ06890 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CluQ06890 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CluQ06890 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CluQ06890 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CluQ06890 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CluQ06890 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CluQ06890 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CluQ06890 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CluQ06890 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CluQ06890 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CluQ06890 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CluQ06890 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CluQ06890 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CluQ06890 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CluQ06890 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CluQ06890 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CluQ06890 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CluQ06890 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CluQ06890 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CluQ06890 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CluQ06890 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CluQ06890 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CluQ06890 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CluQ06890 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms