Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrx2Q06348 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms