Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col9a1Q05722 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col9a1Q05722 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col9a1Q05722 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col9a1Q05722 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col9a1Q05722 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a1Q05722 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a1Q05722 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a1Q05722 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a1Q05722 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a1Q05722 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a1Q05722 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a1Q05722 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a1Q05722 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a1Q05722 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a1Q05722 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a1Q05722 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a1Q05722 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a1Q05722 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a1Q05722 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a1Q05722 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a1Q05722 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a1Q05722 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a1Q05722 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a1Q05722 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a1Q05722 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a1Q05722 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a1Q05722 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a1Q05722 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a1Q05722 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a1Q05722 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms