Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sox10Q04888 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sox10Q04888 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sox10Q04888 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sox10Q04888 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sox10Q04888 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox10Q04888 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox10Q04888 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms