Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Emx2Q04744 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Emx2Q04744 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms