Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcr5Q04683 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms