Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kcnb1Q03717 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms