Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Scg2Q03517 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms