Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfiaQ02780 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms