Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb5Q02739 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb5Q02739 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb5Q02739 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb5Q02739 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb5Q02739 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb5Q02739 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb5Q02739 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb5Q02739 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb5Q02739 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb5Q02739 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb5Q02739 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb5Q02739 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb5Q02739 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb5Q02739 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb5Q02739 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb5Q02739 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb5Q02739 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb5Q02739 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb5Q02739 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb5Q02739 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb5Q02739 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb5Q02739 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb5Q02739 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb5Q02739 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gjb5Q02739 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms