Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkcqQ02111 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkcqQ02111 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkcqQ02111 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkcqQ02111 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkcqQ02111 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkcqQ02111 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkcqQ02111 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkcqQ02111 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkcqQ02111 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkcqQ02111 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrkcqQ02111 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkcqQ02111 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkcqQ02111 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkcqQ02111 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkcqQ02111 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkcqQ02111 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkcqQ02111 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkcqQ02111 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkcqQ02111 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms