Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ascl1Q02067 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms