Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gbp1Q01514 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms