Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Top2aQ01320 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Top2aQ01320 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Top2aQ01320 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Top2aQ01320 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms