Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Grin2bQ01097 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Grin2bQ01097 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Grin2bQ01097 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms