Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbp1Q00915 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms