Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Il6stQ00560 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Il6stQ00560 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms