Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
F8a1Q00558 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms