Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apba2P98084 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apba2P98084 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apba2P98084 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Apba2P98084 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apba2P98084 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Apba2P98084 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apba2P98084 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apba2P98084 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Apba2P98084 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apba2P98084 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apba2P98084 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apba2P98084 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Apba2P98084 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Apba2P98084 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Apba2P98084 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms