Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shc1P98083 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc1P98083 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc1P98083 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shc1P98083 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc1P98083 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc1P98083 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shc1P98083 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms