Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pitx2P97474 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pitx2P97474 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitx2P97474 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms