Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nbr1P97432 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms