Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LystP97412 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LystP97412 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LystP97412 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LystP97412 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LystP97412 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LystP97412 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LystP97412 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LystP97412 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LystP97412 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LystP97412 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LystP97412 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LystP97412 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LystP97412 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LystP97412 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LystP97412 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LystP97412 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LystP97412 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LystP97412 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LystP97412 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LystP97412 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LystP97412 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LystP97412 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LystP97412 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LystP97412 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LystP97412 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LystP97412 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LystP97412 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LystP97412 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LystP97412 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LystP97412 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LystP97412 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LystP97412 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LystP97412 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LystP97412 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LystP97412 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LystP97412 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LystP97412 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LystP97412 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LystP97412 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LystP97412 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LystP97412 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LystP97412 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LystP97412 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LystP97412 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LystP97412 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LystP97412 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LystP97412 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LystP97412 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LystP97412 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LystP97412 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LystP97412 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LystP97412 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LystP97412 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LystP97412 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LystP97412 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LystP97412 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LystP97412 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LystP97412 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LystP97412 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LystP97412 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LystP97412 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LystP97412 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LystP97412 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LystP97412 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LystP97412 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LystP97412 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LystP97412 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LystP97412 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LystP97412 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LystP97412 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LystP97412 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LystP97412 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LystP97412 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LystP97412 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LystP97412 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LystP97412 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LystP97412 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LystP97412 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LystP97412 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LystP97412 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LystP97412 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LystP97412 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LystP97412 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LystP97412 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LystP97412 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LystP97412 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LystP97412 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LystP97412 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LystP97412 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LystP97412 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LystP97412 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LystP97412 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LystP97412 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LystP97412 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LystP97412 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LystP97412 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LystP97412 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LystP97412 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LystP97412 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms