Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkp1P97350 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pkp1P97350 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms