Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhodP97348 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhodP97348 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhodP97348 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhodP97348 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RhodP97348 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RhodP97348 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhodP97348 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RhodP97348 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhodP97348 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhodP97348 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhodP97348 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhodP97348 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhodP97348 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhodP97348 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhodP97348 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhodP97348 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhodP97348 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhodP97348 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhodP97348 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhodP97348 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhodP97348 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RhodP97348 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhodP97348 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhodP97348 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhodP97348 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhodP97348 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhodP97348 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhodP97348 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhodP97348 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhodP97348 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhodP97348 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RhodP97348 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhodP97348 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhodP97348 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhodP97348 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhodP97348 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhodP97348 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhodP97348 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhodP97348 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhodP97348 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RhodP97348 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhodP97348 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhodP97348 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhodP97348 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhodP97348 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhodP97348 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhodP97348 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhodP97348 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhodP97348 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhodP97348 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhodP97348 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhodP97348 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhodP97348 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhodP97348 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhodP97348 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhodP97348 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhodP97348 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhodP97348 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhodP97348 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhodP97348 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhodP97348 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhodP97348 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhodP97348 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RhodP97348 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhodP97348 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhodP97348 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhodP97348 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RhodP97348 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RhodP97348 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RhodP97348 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RhodP97348 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RhodP97348 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RhodP97348 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhodP97348 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhodP97348 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhodP97348 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhodP97348 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhodP97348 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RhodP97348 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhodP97348 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhodP97348 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhodP97348 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhodP97348 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RhodP97348 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhodP97348 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhodP97348 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhodP97348 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhodP97348 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhodP97348 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhodP97348 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhodP97348 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhodP97348 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhodP97348 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhodP97348 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhodP97348 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhodP97348 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhodP97348 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhodP97348 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhodP97348 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms