Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mesp1P97309 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mesp1P97309 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms