Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubg1P83887 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms